Salami munculna Covid, populasi planét mimiti repot ngalawan virus, balap pikeun nyiptakeun vaksin énggal. Nanging, nalika balapan panik, seueur anu hilap yén henteu sadayana virus anu ngabahayakeun pisan. Seueur diantara aranjeunna aya gunana pisan sareng awak urang moal hirup tanpa aranjeunna. Dina The Flappy Virus, anjeun bakal ngabantosan virus anu mangpaat pikeun kabur tina nembak vaksin anu bahaya. Aranjeunna ngabahayakeun pikeun anjeunna, sareng anjeunna, sapertos mahluk hirup naon, hoyong salamet. Ku ngaklik karakterna, anjeun bakal ngajantenkeun anjeunna ngapung langkung luhur sareng handap. Éta dina tingkatan anu tangtu. Ngiringan gim jarum suntik anu seukeut, éta nempel moal ngan ukur ti handap tapi ogé ti luhur dina The Flappy Virus.
