Ahir-ahir ieu, Karajaan Jamur geus tiiseun jeung tenang, malah teu aya anu nyulik Putri Persik. Di hiji sisi, ieu pleases tukang ledeng Mario, sarta di sisi séjén, relaxes anjeunna. Malah penjahat Bowser nyumput. Dina kaulinan Run Mario Run, Mario mutuskeun pikeun ngamimitian jogging unggal dintenna pikeun tetep pas sareng siap pikeun kajadian naon waé. Bowser kaget sareng anjeunna langsung nempatkeun antek-antekna dina sadaya jalan pikeun ngarusak tukang ledeng. Pitulung pahlawan deftly luncat ngaliwatan halangan jeung villains leutik dina Run Mario Run.